AICD-3.0.4的安装

参考：Visualization of Aromaticity: AICD

AICD

正版需要给Dr.Herges(rherges@oc.uni-kiel.de)写邮件索取。如英语不好，可以在[其它] AICD 3.0.4安装包分享下载AICD3.0.4。执行：

tar xvf AICD-3.0.4.tbz
cd AICD-3.0.4
make

make输出类似于：

(obabel) [sun@s02 AICD-3.0.4]$ make
g++ -Wall -O2 -ffast-math -march=native  -Wl,-s  AICD-cube.cc   -o AICD-cube
g++ -Wall -O2 -ffast-math -march=native  -Wl,-s  AICD-extract.cc   -o AICD-extract
g++ -Wall -O2 -ffast-math -march=native  -Wl,-s  AICD-opt_remap.cc   -o AICD-opt_remap
g++ -Wall -O2 -ffast-math -march=native  -Wl,-s  AICD-remap.cc   -o AICD-remap
g++ -Wall -O2 -ffast-math -march=native  -Wl,-s  AICD-rotate_mol.cc   -o AICD-rotate_mol
g++ -Wall -O2 -ffast-math -march=native  -Wl,-s  AICD-smooth_isosurface.cc   -o AICD-smooth_isosurface
echo "export AICD_Version=`cat VERSION`" > AICD-version.inc 
(obabel) [sun@s02 AICD-3.0.4]$ 

加入bashrc：

echo "alias AICD=\"$PWD/AICD\"" >> ~/.bashrc

测试:

(obabel) [sun@s02 AICD-3.0.4]$ ./AICD

Zweck: Extraktion der induzierten Stromdichte (ICD)
       aus einem oder mehreren Gaussian98-log-files.

Dieses Script liest die angegebenen Dateien und
wandelt sie in mehrere Dateien um.

Aufruf: ./AICD  Gaussian98-output-file(s)

(obabel) [sun@s02 AICD-3.0.4]$ 

povchem

上述帖子也提供了povchem.c、povchem.cfg、povchem.tab。下载到本地，在povchem.c目录执行

cc povchem.c -o povchem -lm
echo "alias povchem=\"$PWD/povchem\"" >> ~/.bashrc

然后将povchem.cfg和povchem.tab复制到AICD-3.0.4/povchem目录下。

PovRay 3.6

从Download POV-Ray 3.6下载POV-Ray 3.6版本。

tar -xzf povlinux-3.6.tgz
cd povray-3.6

如果你没有root权限，执行这个命令，然后选U：

./install -no-arch-check

如果有，直接使用：

sudo ./install -no-arch-check